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lammps教程:run命令使用技巧,多次run正确写法
本文介绍run命令的几种不同用法。 run命令是lammps模拟中必不可缺的一个命令,主要功能是设定运算步数并启动运算。 最常见的命令是run+步数,其实,run命令还有更高级的应用,下面分类介绍run命令的用法。 (1)运行N步:run N run+步数是用的最多的一条命令,主要功能是运行N步。 例如,run 1000 指在当前状态下继续运行10…
lammps教程:in文件结构详解以及一个比较实用的in文件模板
lammps软件只是一个求解器,没有可视化的前处理和后处理软件,所有的命令只能通过代码的方式输入到求解器进行求解计算。 所有的命令都被写到一个称为“in”的文件里,对于初学者来说,熟悉in文件的编写是一个难点。 in文件其实就是一个文本文档,也没有要求文件名或者后缀名中必须带有“in”字样,用任何文件名均可运行。 in文件里的代码是按照编写的顺序进…
lammps教程:nve/nvt/npt系综设置方法
系综是指大量性质和结构完全相同的、处于各种运动状态的、各自独立的系统的集合。 在lammps模拟中,常用的系综有nve、nvt、npt三种系综,下面说说这三种系综的使用方法。 1. nve(微正则系综) nve系综保证系统中原子数量n、体系总体积v和体系总能量e保持不变。 nve系综没有控温的功能,初始条件确定后,在力场的作用下,原子速度发生变化,…
lammps中data文件的建立
Data文件书写步骤 lammps中关键的一步是data文件的建立,这里总结3种不同的方法来建立data文件。(个人推荐方法二) 方法一 首先通过Ms建立模型,然后输出cif或者pdb格式文件(最好用pdb格式文件,因为pdb格式文件包含电荷);其次,通过Atomsk进行格式转化,将cif格式转换成lammps识别的lmp格式文件;(注意:MS导出…
Windows环境下LAMMPS使用GPU加速运算
1.安装Lammps 下载安装lammps https://rpm.lammps.org/windows/64bit/LAMMPS-64bit-latest-MPI.exe 2.安装mpich2 首先参考了以下三个博客: https://blog.csdn.net/muyangzixue/article/details/112758801 http…
WSL2子系统Ubuntu安装Lammps with GPU
安装WSL2子系统 首先打开Windows powershell,以管理员身份运行,输入 wsl --list --online 查看可用的Linux版本,我选的是Ubuntu 之后使用 wsl --install -d Ubuntu 安装 退出子系统后,输入wsl重新进入Ubuntu,相当于重启系统。 命令 wsl --list --verbos…