进行lammps模拟，如果初始模型不合理、原子间距离过近，容易导致体系能量过高，原子速度过快致使原子飞出box。

前文介绍过“delete_atoms”命令可删除重叠或距离过近原子，但在大多数模型中，并不需要删除原子，有些模型也不允许删除原子，这时候就需要用到minimize命令。

1. minimize命令

minimize命令通过力的计算排开距离过近的原子，使体系的能量降到一个较低的水平，便于后续的弛豫操作。

minimize语法为：

minimize etol ftol maxiter maxeval

后面四个参数为minimize运行停止条件，其中etol、ftol分别为能量和力的容差，maxiter、maxeval为迭代最大步数。

在最小化过程中，达到四个条件中的任意一个时，最小化即停止运行。

力或者能量已经降低到一个较低水平，或者力或能量还没有降低到一个低值，但设定的迭代步数已经用完，都会停止最小化。

2. min_style命令

minimize最小化采用的算法由min_style命令确定，min_style语法为：

min_style style
style = cg or hftn or sd or quickmin or fire or fire/old or spin or spin/cg or spin/lbfgs

最常用的为共轭梯度法（cg）、最速下降法（sd）。

3. 使用举例

min_style cg
minimize 1.0e-4 1.0e-6 100 1000

如果已经进行了最小化，但是后续弛豫仍然会报错，可查看log文件，排查minimize运行停止的条件，适当调小能量和力的容差或者加大迭代步数。

如以上语句可改为：

min_style cg
minimize 1.0e-15 1.0e-15 10000 10000

mimimize可有效降低出错概率，是一个谁用谁知道，用了都说好的命令。